Ceny transferowe są obszarem, który podlega stosunkowo częstej kontroli, typowanie odbywa się na podstawie formularzy TPR-C oraz TPR-P oraz przedstawionych na nich informacji. Analizie poddawane są transakcje zawarte w okresach, które nie uległy jeszcze przedawnieniu.
W roku 2023 wytypowanych do kontroli w zakresie cen transferowych zostało 295 podmiotów, z czego aż 208 kontroli wykazało nieprawidłowości, prowadzące do doszacowania blisko 447 mln złotych dochodu oraz 161 mln zmniejszenia straty. Dla podatników wiązało się to z wpłatami należności na rzecz organów w kwocie razem około 84 mln zł, co daje średnią kwotę należności około 403 tys. zł przypadającą na jednego podatnika, u którego wykryto nieprawidłowości w obszarze cen transferowych.