27 stycznia 2022 r. Dyrektor Informacji Skarbowej wydał interpretację indywidualną (sygn. 0112-KDIL2-1.4011.981.2021.4.DJ) dotyczącą Estońskiego CIT funkcjonującego w stanie prawnym obowiązującym do końca 2021 r. W interpretacji DKIS uznał, że nie można pomniejszyć PIT wspólnika o podatek uiszczony przez spółkę opodatkowaną estońskim CIT, jeśli spółka w trakcie roku wypłaci wspólnikowi zaliczki na dywidendę. DKIS oparł swoje stanowisko na literalnym brzmieniu art. 30a ust. 19 ustawy o PIT w formie obowiązującej do końca 2021 r. (obecnie przepis ten został zmieniony). Łączny podatek od spółki i wspólnika mógłby wynieść wtedy nawet 39% (od 2022 r. – 35%), czyli 20% od spółki i 19% od wspólnika, ponieważ niemożliwe jest zastosowanie mechanizmu odliczenia jednego podatku od drugiego.
Jak już wyżej wskazano, interpretacja dotyczyła stanu prawnego obowiązującego do końca 2021 r. Po zmianach wprowadzonych od 2022 r. taka sytuacja nie powinna wystąpić, ale nadal istnieje jednak ryzyko niekorzystnej interpretacji ograniczającej prawo pomniejszenia PIT od wypłaconej zaliczki na dywidendę. Nie można wykluczyć, że tak samo jak wcześniej, stąd spółki korzystające z estońskiego CIT powinny się wstrzymać z wypłatą zaliczek na poczet dywidendy. Przed podjęciem decyzji o wypłacie dywidendy warto zaczekać na kolejne interpretacje indywidualne dotyczących aktualnego stanu prawnego, gdzie potwierdzona zostanie możliwość korzystania z niższego opodatkowania również przy wypłacie zaliczki na dywidendę. Na ten moment bezpieczniejszym rozwiązaniem dla spółek opodatkowanych estońskim CIT jest niestosowanie odliczenia w momencie wypłaty zaliczki na poczet dywidendy i wystąpienie z wnioskiem o stwierdzenie i zwrot nadpłaty podatku.